基因组坐标处理的通用技能:在 BED、GFF/GTF、VCF、SAM/BAM、WIG、PSL、genePred、Picard interval_list 与区域字符串之间转换区间,统一 0-based 半开与 1-based 闭区间,左对齐或裁剪 indel,核对两条变异记录是否描述同一变化,并诊断 GRCh37/hg19/GRCh38/T2T、chr 前缀与 liftover 问题。适合跨格式、跨工具、跨组装的坐标与变异一致性校验。
安装方式:打开 GenHub 客户端 → 技能市场 → 搜索「基因组坐标转换」→ 一键安装。
安装指南
复制下方命令,在终端运行即可安装:
# 安装到当前项目
npx skills add genomic-coordinates
# 全局安装 — 所有项目可用
npx skills add genomic-coordinates -g
需已安装 GenHub 桌面端
使用指南
安装完成后,在对话框中直接使用此技能。