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基因组坐标转换

基因组坐标处理的通用技能:在 BED、GFF/GTF、VCF、SAM/BAM、WIG、PSL、genePred、Picard interval_list 与区域字符串之间转换区间,统一 0-based 半开与 1-based 闭区间,左对齐或裁剪 indel,核对两条变异记录是否描述同一变化,并诊断 GRCh37/hg19/GRCh38/T2T、chr 前缀与 liftover 问题。适合跨格式、跨工具、跨组装的坐标与变异一致性校验。

安装方式:打开 GenHub 客户端 → 技能市场 → 搜索「基因组坐标转换」→ 一键安装。

来源:K-Dense-AI/scientific-agent-skills(MIT)

安装指南

复制下方命令,在终端运行即可安装:

# 安装到当前项目
npx skills add genomic-coordinates
# 全局安装 — 所有项目可用
npx skills add genomic-coordinates -g
⚡ 一键安装到 GenHub

需已安装 GenHub 桌面端

使用指南

安装完成后,在对话框中直接使用此技能。

基本信息
作者 K-Dense-AI / CodexHub CN 分类 efficiency 难度 Intermediate 时长 30 min
🛠️ 安装命令
# 安装到当前项目
npx skills add genomic-coordinates
# 全局安装
npx skills add genomic-coordinates -g

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