基因组坐标处理的通用技能:在 BED、GFF/GTF、VCF、SAM/BAM、WIG、PSL、genePred、Picard interval_list 与区域字符串之间转换区间,统一 0-based 半开与 1-based 闭区间,左对齐或裁剪 indel,核对两条变异记录是否描述同一变化,并诊断 GRCh37/hg19/GRCh38/T2T、chr 前缀与 liftover 问题。适合跨格式、跨工具、跨组装的坐标与变异一致性校验。
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